Archive for 八月, 2007

斯丹尼·米勒和他著名的米勒-尤瑞实验

斯丹尼·米勒和他著名的米勒-尤瑞实验

文:尼伯龙根·蜗藤

美国科学家斯丹尼·米勒博士(Dr. Stanley L. Miller)是研究生命起源问题的先驱。他于2007年5月20日悄然离去,终年77岁。生命起源研究领域由此失去了一位伟大的科学家和旗手。

米勒博士最有名的恐怕就是他在1953年的实验,科学界称为米勒-尤瑞实验(Miller-Urey Experiment)。当时,米勒是芝加哥大学的研究生,而他的导师就是尤瑞博士(Dr. Harold Urey)。米勒的实验是关于有机分子的特别是氨基酸的自然生成问题的。这个实验成为生命科学史上的一个经典实验,所有论及生命起源和进化的教科书都不能不提及它。

所谓有机化合物,我们现在都知道是以碳,氢为主,辅以氧、氮、磷等物质的化合物,我们现在也知道很多有机物都能人工合成。但是在19世纪30年代以前,人们普遍认为有机物只有有生命的物体才能制造出来,因而有一种神秘的力量,和一般的无机物有不可逾越的界限。1828年德国科学家武勒(Friedrich Wöhler)成功地从无机物氰酸胺中合成出有机物尿素。从而成功地打破了有机物和无机物的界限。随着有机化学的进展,人们才开始打破对很多有机物的神秘感。生命和非生命的距离开始拉近了。

但是即便到了20世纪,人们对无机物、有机物和生命之间的关系还不甚了了。简单的有机物固然可以从无机物中人为的合成出来。但是复杂的有机物,比如对生命而言最重要的氨基酸和核酸能否从简单的无机物中在自然条件下生成呢?这个直接和生命如何起源问题相关。科学家们比如苏联科学家Operin推测生命是从非生命的无机物中发展而来的。他认为在早期地球上,自然环境和现在完全不同,在那种条件下,从无机物中生成复杂有机物是有可能的。但是这个生命起源中其中一个最重要的问题却一直只能停留在猜测阶段。

米勒-尤瑞的实验就是对这个问题的直接回答。尤瑞认为现今木星上的大气成分很可能的就是地球形成之初的大气成分,它主要由一些还原性的气体,比如氢气、甲烷、二氧化碳和水蒸气组成。于是米勒就设计了一个实验,看看在这种条件下,到底能不能产生出生命所需的分子。米勒的设计也不十分复杂(图二),主要由两个烧瓶组成。右上角的烧瓶1里装着由氢气、甲烷、氨气和水蒸气组成的气体,模拟的是地球早年冥古宙时期的大气,左下角的烧瓶2里装的是水,模拟的是当时的海洋。两个烧瓶之间有两根管道相通,右边的管道3是一个冷凝管,烧瓶1的气体可以通过它凝固而流到烧瓶2;左边的管道4是一个导管,烧瓶2中水蒸发的蒸汽可以通过它到达烧瓶1。这样就米勒就构建了一个能够不断循环的系统。烧瓶1中有两个电极,可以连续产生闪电,模拟了当时地球闪电不断的环境。烧瓶2中有加热器,模拟了当时地球的高温。

这个实验进行了一个星期,最后形成了很多黑色的糊状物(图3)。

米勒分析了这些糊状物的成分,结果非常有突破性。有12-15%的碳变成了包括糖,脂类在内的有机物,更重要的是,2%的碳形成了13种生物体必须的氨基酸。这个实验的意义在于,起初的反应物只是简单的分子,但是却能产生出生命必须的原料。这个结果,完全符合了达尔文和Oparin等人的设想。为生命的起源的研究迈出了踏实的第一步。

当然,后来的证据显示出米勒的实验也有不足之处,最大的问题在于他所选取的气体成分:尤瑞假设的地球早期大气成分类似于木星的气体成分是不对的。当时的地球气体并非如此地具有强还原性,而是偏中性,以水蒸气、二氧化碳和二氧化硫为主。这种气体成分下,产生复杂分子比较难一些。但是,科学家们随着米勒的思路,试验了各种气体成分和各种反应条件,到最后也都能产生出氨基酸和其它复杂的有机物(见下表)。

见(http://www.ncseweb.org/icons/figure01.htm

米勒-尤瑞实验和著名的DNA双螺旋结构的提出几乎是同时发表的。这在当年大大的激发了科学家们对生命研究的热情。科学家Max Bernstein写道:当年的这两个发现仿佛一下子把生命的奥秘揭示在人们的眼前,科学家们似乎就快要探求得到生命的本源。当然,我们现在知道,科学家当年是过于乐观了。生命这个东西,你越研究就越是发现它的复杂。但是由于米勒的开创性实验,我们也很有把握的说,we are on the right track。

米勒在研究生毕业后继续从事生命起源的研究工作,位至加州大学圣地亚哥分校的终生教授。因为他的突出贡献,他成为了美国科学院院士,并于1983年获得了生命起源研究领域中的最高荣誉Oparin Medal。

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灭顶之灾——历史上的天体撞地球事件

灭顶之灾——历史上的天体撞地球事件


文:尼伯龙根·蜗藤

彗星撞地球是众多灾难片的主题,现代历史上也有天体撞地球的记载,比如通古斯之谜等等。但是,这些灾难和地球历史上天体袭击事件比起来,都不过是小巫见大巫而已。历史上最为人所知的一次彗星撞地球发生在6千5百万年前,它直接导致了巨无霸恐龙的覆没。然而,那次撞击事件的破坏力在最大的四次彗星撞地球的历史上只能名列最末,而这四次最大的彗星撞击深刻地改变了地球的发展进程。

第一次大撞击:“火星”撞地球

第一次大撞击发生在45亿年前。那时地球还初生不久,处于混沌状态。地球的分层还没有完成,尽管地核已经形成,地壳却还未出现,地球表面是岩浆的海洋。这时,一个名叫Theia的天体撞向了地球。对比起以后撞击地球的天体,Theia是个庞然大物,体积有火星那么大,也就是说直径达到了地球的一半,是名副其实的“火星”撞地球。

据科学家推断,Theia本来是和地球同源的的一个运行在地球轨道上的一颗行星,运行方向和地球一样,但是比地球快或者慢60度角。这个位置,在天文学上叫做拉格朗日点(如下图所示的L4和L5),是小天体在两个大天体间能够取得稳定平衡的点。这种行星共享轨道现象看上去很奇怪,但其实即便在太阳系中都不少见。比如在木星的轨道上,就有两群群小行星,特洛伊(Trojans)和希腊(Greeks),分别位于木星前60度和后60度的地带。Theia本来也有望成为和特洛伊小行星一样的小行星群,无奈自己起初的体积较大,所以不断吸引周边的宇宙物质,个头就逐渐大了起来,于是轨道就变得不稳定,跑得忽快忽慢,偏离了平衡点,最终就一头栽倒地球上去了。这个碰撞可谓惊天动地,Theia自身完全毁灭,绝大部分被地球兼并了。但是地球也损失惨重。一大堆岩浆在剧烈的碰撞后,如同井喷一般,一飞冲天,脱离了地球,而这批岩浆日后就成了月球。

Theia撞击地球示意图

Theia撞击地球模拟图

第二次大撞击:真正毁灭性的小行星雨

地球遭受的第二次大冲击当数40亿年前到39亿年前的一轮小行星冲击。小行星是处于火星和木星之间的一群小天体。40亿年前,小行星带受到某些因素的影响,带内无数的小行星向类地行星冲去,火星、地球、月球、金星和水星无一幸免,史称晚期重型轰炸事件(Late Heavy Bombardment,LHB)。这场轮番轰炸持续了几百万年。

据估算,在这个过程中在地球上形成了约2万个直径大于20公里的陨石坑,其中大约有40个直径在1千公里以上,还有几个直径甚至达到5千公里。其它类地行星和月球同样也是伤痕累累,直径大于20公里的陨石坑都有成千上万个(Kring & Cohen,2002)。在这种密集的冲击下,地球长期处于一种固化和半融化之间的状态,几乎每100年,地表就会重新塑造一次。

LHB事件的成因目前还没有定论。但是很可能与大行星的急剧迁移有关(Gomes et al,2005),也可能与天王星和海王星的形成有关。这些大行星形成的时间比较晚,它们的形成和走上现在的轨道必然会对小行星带有很大的冲击,很可能导致了小行星的集体疯狂行为。

对于地球生态来说,这无疑是最具破坏力的一次。之前Theia虽然对地球的冲击力更大,但是当时地球尚处于洪荒时代,并无任何生态可言。但是这轮小行星冲击发生的时候,地球已经发展出完整的地壳,已经有了海洋和大气,甚至可能有了初步的生命形态。可是因为小行星这一连串的冲击,地壳又重新处于半融化状态,早期地球形成的岩石都在这段时间内被重新融化,以致在地球上再也找不到39亿年前的岩石了。从这种意义上来说,小行星的冲击导致地球的发展倒退了几亿年。现在,人们唯有从遗留下来的古老合金鋯石(Zircon)中才能寻觅LHB之前地球的蛛丝马迹,而从鋯石上找到的水的痕迹说明在44亿年前,地球上已经出现了海洋。

由于目前在地球上能找到的原产于地球的岩石都在LHB之后,所以LHB就成为了冥古宙和太古宙的分界线。LHB抹去了地球在冥古宙的绝大部分记忆,也让地球有了一个新的开端。在它之后,地球就没有再遭受过毁灭性的打击,为生命的起源和发展奠定了和平的契机。另外,小行星的降临可能带来了一大部分生命的原材料,而它的冲击也为地球上生命原料的合成带来充足的能量。

既然在LHB之前地球上已经有海洋,那么在LHB之前地球上是否出现过生命?这的确是一个有趣的问题。就人类所知,最早的细胞在35亿年前出现,而最早的生命痕迹在38亿年前就已经出现了。生命能在短短一亿年间(从39亿年前到38亿年前之间)从无到有地产生吗?而一些DNA对比的研究显示古细菌和细菌的共同祖先更有可能 42亿年前就出现了。当然DNA对比的结果不一定可靠,只能仅存一说而已。Zircon矿石中水痕迹的发现表明在大轰炸之前和之后,尽管地貌发生翻天覆地的变化,但是基本的东西却没有什么不同:固体的地壳、海洋和大气等基本的生态因子都已经存在。既然如此,在太古宙发生的生命进程,可能在冥古宙也已经发生过了。那么冥古宙是否产生过最原始的生命呢?如果有的话,它们是被大轰炸彻底摧毁了,还是能侥幸逃过一劫,在太古宙焕发新生呢?在没有确切答案之前,我认为生命在冥古宙是有可能产生的,但是大轰炸的威力如此之大,很难想象原始生命能存活。生命看似复杂,但是最原始的生命可能只是很简单的东西,完全有可能在合适的条件下在一亿年间出现。

冥生宙地球环境示意图

第三次撞击:古生代群的终结

如果说LHB的袭击可能只是摧毁了地球上的生命的话,那么发生在2亿五千万年前的处于二叠纪和三叠纪之交的灾难就确确实实是生物界的灭顶之灾了。作为有据可查的历史上最严重的一次灭绝事件,P-T灭绝事件使得大约80%的海洋生物从此消失,彻底改变了海洋生物的生态。

二叠纪是古生代最后一个年代,动植物都已经登陆,但是海洋还是生物传统势力的天下。古生物学家把历史上海洋生态群分为三类:寒武纪型(Cambrian Fauna)、古生代型(Paleozoic Fauna)和现代型(Modern Fauna)。这三类不同的种群最明显的区别在于捕食者的生态,而捕食者不同的生态导致整个种群的生物的构成不同于其它种群。寒武纪型的捕食者以海底匍匐觅食为主,最具代表性的是三叶虫。这类种群在奥陶纪后就衰落了。取而代之的是古生代型的种群,这类种群的捕食者以过滤捕食为主(filter feeding)。珊瑚虫和腕足类动物是该种群的代表,它们在浅海或守株待兔或缓慢游动,写意地享用各种食物。古生代型种群在奥陶纪之后占据了绝对性的优势,之后发展平缓,但是在二叠纪末期急剧下降,最终也未能恢复过来。而现代型的种群的捕食者则以快速捕食为主,古生代的鲨鱼、中生代鱼龙和新生代的海豚等都是其代表。古生代末期,现代型种群的繁荣程度已经追上了古生代种群,但是还没有决定性的优势。直到二叠纪末的P-T大灭绝严重打击了古生代类群后,现代型种群才占据优势。

二叠纪末的大灭绝是生物史上最严重的灭绝事件,对海洋生物尤是。据统计,有57%的海洋生物的科完全灭绝,灭绝的海洋生物物种更高达95%。古生代型种群从此一蹶不振。现代型生物种群虽然也备受打击,但终不致灭顶,恢复得也快,从而奠定了之后2亿多年的统治性基础。陆地上的情况也好不了多少,48个科的四足兽,仅仅有12个科存活下来。这个事件也标志着古生代的结束和中生代的开始。

这个大灭绝事件的成因一直都有争议。有人把它形容成“东方快车谋杀案”,也就是多种因素共同作用引起,火山爆发、地震和地壳板块碰撞等等都是原因。而这一切的罪魁祸首,就是一颗小行星的冲击。关于小行星撞击引发一连串事件,最终导致大灭绝的猜测,在多年前已经存在。但是直到2003年Asish Basu等人在《科学》杂志上发表了有关证据之后,这一猜想才被广为接受。根据相关证据显示,在二叠纪末期,曾经有一颗小行星一头撞向地球的南极洲。当时所有的大陆都是连成一体的,南极洲的位置和现在的相差不远。碰撞之后,早已酝酿多时的火山爆发、地震和地壳板块迁移被一下子激发出来,最终导致了这次史上最严重的灭绝事件。

第四次撞击:恐龙时代的终结

第四次撞击是最为人所知的一次,发生在6千5百万年前。当时一个直径约10公里的小行星一头撞向现墨西哥的Yucatan半岛,撞出一个直径达到180公里的大坑。这个大坑是目前能确认位置的最大的陨石坑。在撞击点800公里之外的海地,找到一种含有glass spherules的粘土,时间上正和这次撞击吻合,而这种粘土只有在1300度的高温下才能产生,可见当时冲击的威力有多大。据科学家估计,当时冲击的威力相当于1亿个百万吨(megaton)的TNT炸药,而一个氢弹的威力只相当于区区几十个百万吨TNT炸药!有的科学家相信当时袭击地球的小行星还不止一个,因为在现在意大利的Gubbio和印度的Deccan平原(当时印度刚刚和非洲脱离不久,还没有连上欧亚大陆)也发现了类似同时代的陨石坑。如果那是真的,那么它们的联合作用就更加惊人了。

Yucatan 半岛,小行星坠落的地方。 

glass spherules示意图

如果说二叠纪末期的大灭绝对海洋生物影响最大的话,那么白垩纪之末的这次撞击就是对陆生动物的大灾难。我们熟悉的恐龙在这次灾难中全军覆没,无一幸免;绝大部分的鸟类灭绝了;北半球的有袋类动物也灭绝了。灭绝的四足兽的科高达50%。在海洋方面,蛇颈龙和沧龙等海生爬行动物灭绝了,和它们一起消亡的还有大约20%的软骨鱼和10%的硬骨鱼类。

这个灾难中灭亡的动物虽然没有上一次的多,但是由于对陆生动物影响巨大,成为中生代和新生代的分界线。大部分爬行动物的灭绝为哺乳动物留下了广阔天地,在新生代,哺乳动物终于一扫一亿多年来被恐龙压制的“怨气”,从黑暗中走出来,成为地球上的统治性动物,也为人类的出现铺平了道路。

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柏拉图式的恋爱真是无性之爱吗?

柏拉图式的恋爱真是无性之爱吗?

文:尼伯龙根·蜗藤

柏拉图式的恋爱常被现代人理解成为无性的精神恋爱,特别是男女之间纯洁的爱情。但其实这不过是对柏拉图一个天大的误解,而这个误解到底从何而来?

柏拉图谈及爱情观的著作主要集中在两本书里。一本是《会饮篇》(The Symposium),另一本是《菲多篇》(The Phaedrus)。对柏拉图式的恋爱的误解大多源于《会饮篇》中的一个故事:在一个希腊贵族的聚会中,一个名叫阿尔西比亚德斯(Alcibiades)的人闯了进来。他已经喝得大醉,看见自己钦慕的苏格拉底(Socrates)和另一个俊美的少年“亲密”地同椅共饮,于是醋意大发地向众人讲述了自己之前如何色诱苏格拉底不遂的经历。

对于柏拉图著作不熟悉的读者可能会疑惑:不是说柏拉图吗?怎么和苏格拉底拉上关系了?其实柏拉图在写东西的时候,用对话的形式把自己的哲学理念表达出来,所以他的著作也被人称为《对话》(The Dialogues)。在他的著作中,主人公就是苏格拉底。众所周知,苏格拉底是柏拉图的老师,但是研究柏拉图的学者都认为,柏拉图的著作虽然以苏格拉底为主角,但是大多数时候其实是柏拉图把自己的思想借苏格拉底的口说出来。

当时的希腊上层男性贵族流行同性恋。柏拉图的这两个作品都对此有细致的描写。当时的观念认为男女之间的恋爱大多是基于生理需要的恋爱,但这里所指的生理需要可不是我们现在理解的性需要,而是指繁衍后代。这虽然是必须的,但也因此变得“低下”。所以高尚的爱情多数只产生于男人和男人之间,更准确的说是成熟男人和美少年之间。而柏拉图更是唯一崇尚同性之爱。

那么阿尔西比亚德斯是什么人呢?其实他是希腊历史上一个响当当的名人。他是雅典的将军(strategoi),帕罗奔尼撒战争中的著名的西西里远征就是他的创意。不过在《会饮篇》描述的聚会时,阿尔西比亚德斯只是一个十八岁左右的青年。阿尔西比亚德斯曾经在战斗中被苏格拉底救过,对苏格拉底既亲密又仰慕。在《会饮篇》的故事描述中,阿尔西比亚德斯酒醉之后闯入宴会,以为苏格拉底喜欢上了另外一个美少年Agothan。阿尔西比亚德斯自认美貌不逊于Agothan,可是苏格拉底却对自己没有兴趣,于是他醋意十足地向众人讲述了苏格拉底和他的交往。据他说,虽然苏格拉底之前对他的举动颇为暧昧:苏格拉底对他非常关心,而且尽其所知地教导他,而且还承认喜欢他的美色,但是苏格拉底偏偏对他没有性的欲望。有一天晚上,阿尔西比亚德斯下定决心去色诱苏格拉底。他千方百计把苏格拉底留在家中过夜,把自己的斗篷脱下给苏格拉底盖上,并搂着苏格拉底同床共寝了一晚。但令阿尔西比亚德斯感到羞辱和愤慨的是:苏格拉底那晚除了睡觉之外,竟然没有对他干过其它任何事。

这个故事大概就是柏拉图式的恋爱被误解为没有性的精神恋爱的来由。但事实上,苏格拉底之所以和阿尔西比亚德斯没有性交,是因为他认为自己和阿尔西比亚德斯之间发生的并不是真正的爱情。他喜欢阿尔西比亚德斯俊美的外型,也悉心地教育和关心他,而后者也仰慕自己并对自己充满欲望,但这都不足以成就他心目中真正的爱情。所以,苏格拉底对阿尔西比亚德斯“坐怀不乱”根本不能作为苏格拉底(即柏拉图式)的爱情把性行为排除在外的证据。

从柏拉图对同性之爱的赞美来看,柏拉图从来没有把性排除在爱之外。但是柏拉图确实又是看不起异性见的性行为的。他认为:人类的爱有两种,自然的和非自然的。自然(natural)的爱是指男女异性的爱,在他看来,这种爱是来源于人类的兽性,纯粹是一种低下的本能。但是同性之爱不同,恋人既能享受性的快乐,又不会有繁殖之虑。因此同性之爱是非自然的(unnatural),是能够进行精神交流的爱情。

柏拉图努力地把性和爱分开,并不是认为性欲与爱无关,而是因为在当时的希腊社会,“性”其实就是男女间的为生殖需要而发生的关系,这和他心目中的的爱背道而驰。在柏拉图看来,真正的爱情是以至高无上的、永恒的美德(The Form of Goodness and Beauty)和智慧(wisdom)为目标,而人们对于爱情的追求其实是对绝对的美和智慧的渴望,正是这种渴望引发了恋人之间的相互吸引。所以真正的爱不是因为繁殖的需要,也不是因为无聊(Lack of interest)。从这种意义上来说,真正的爱情是理性的,不会停留在恋人的外表和性欲,也不会一成不变,而是永恒的追求,而这种纯粹的对爱的追求只有在同性间才能做到。

因此,每当听到人们用柏拉图式的恋爱来形容男女间的精神恋爱的时候,我都会觉得非常荒谬。柏拉图在性爱方面是个极端主义者,是完全的同性恋者,他终生未婚,也从来没有发生过组织家庭的念头。尽管希腊贵族中同性恋非常普遍,但是绝大部分人都是双性恋的,包括他的老师苏格拉底(苏格拉底有自己的家庭和孩子)。从这种意义上说,即便是在同性恋盛行的古希腊社会,柏拉图其实也是一个颇为特立独行的人。他大概从来没有想过自己的性爱观会被后人作一个180度的扭曲吧。

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亚马逊河成了名正言顺的第一大河

亚马逊河成了名正言顺的第一大河

文:尼伯龙根·蜗藤

人都有爱好排名的天性,科学家们也不例外。哪一条河是世界第一大河的争论最近又抓住了人们的眼球。

比较河的大小,无外乎几个方面,河的长短,流域面积,水流量等等。无论从流域面积和水流量来说,位于南美的亚马逊河都是以远抛次名的姿态居于榜首。亚马逊河的流域面积有六百九十一万平方公里,远超次名刚果河的三百六十八万平方公里。亚马逊河的平均流量为二十二万立方米每秒,而处于第二位的刚果河只有四万多立方米每秒。然而,亚马逊河不能独霸天下,是由于有一个指标始终被压一头,这就是长度。亚马逊河的长度为6387公里,屈居在尼罗河的6690公里之下,只能名列第二。

尼罗河是一条很有趣的河,它名气很大,因为它是古埃及的发源地,而且长度位列世界第一。但是作为一条大河,它的其它指标却非常寒碜。它的流域面积只有二百八十七万平方公里,位列亚马逊河、刚果河、奥巴河和密西西比河之后,只能排世界第五。而另一个指标水流量更是见不得人,只有区区五千立方米每秒,只能排全球30名左右。我国的长江、珠江、黑龙江、澜沧江和雅鲁藏布江的水流量都比它大。尽管如此,由于它的长度很长,所以排世界第一大河时,它总能排在第一位,亚马逊河就只能排第二。这个排名让很多科学家和公众都觉得不对劲,所以有人提出应该有两套系统,最长(longest)的河是尼罗河,而最大(strongest)的河是亚马逊河。他们觉得这样对亚马逊河才足够公平。

其实,河流长度的测量一向问题多多。有几个因素影响着河流的长度。首先是河流的源头的确定,其次是入海口的确定,最后是从源头到入海口的准确长度测量。河流的源头有几种情况,可以是湖泊,也可以是沼泽。还可以是地下水涌出地面的小泉(spring),最后还可以是冰川的融化。这几种情况,除了湖泊作为源头的情况之外,都很难准确地确定源头所在。即便是湖泊作为源头的情况,如果湖泊季节性地变大变小的话,其准确的源头也不好确定。

入海口的确定,有时候也是非常难的,很多河流在入海口的地方都形成了三角洲(estuary),所以河流和海的分界线难以确定。更有的河流的三角洲由很多支流组成(比如我国的珠江),这样子的情况就更加复杂了。

最后是长度的准确测量。这个问题的关键在于地图的准确性,属于技术性的部分。如果一份地图比较粗略,而河道又比较弯曲的话,很多拐弯的地方就会被忽略,这样就会导致河流的长度被计算过短。亚马逊河的上游就是这样的情况。这点这在卫星定位等技术下有望较好的得到解决。

最近一篇报道又掀起了这个第一长度之争。据BBC的报道指出,巴西地理与统计研究所的以Guido Gelli为首的研究人员的研究表明,亚马逊河的源头不是在传统认定的北部秘鲁,而是在南部秘鲁的一个叫Mismi的山上。这样一来,亚马逊的总长度就是6800公里,比尼罗河的6690公里长,亚马逊河就连总长度也是世界第一,成为名副其实的世界第一大河了。

这个报道有点奇怪,因为报道没有明确指出那个传统认定的北部秘鲁的源头到底是哪里。我翻查了一些资料,比如大英百科全书(2001版),Encarta百科全书(2002版)等,它们都明确指出了亚马逊的源头在Mismi山。再翻查一下记录,原来在1996年的一个探险中,科学家就已经指出这个源头在Mismi山了

http://www.palkiewicz.com/ekspedycje/index.php?p=zrodl_amaz)。不过那时还没有确定到底Mismi上的哪里才是真正的源头,也没有最终的长度测量结果。这次的科学家声明应该只是最终确定了哪里是真正的源头。所以BBC的报道不免有点哗众取宠之嫌。

至于旧的源头在哪里,由于我手头上没有足够旧的书籍,所以只能把亚马逊河上游的情况介绍一下,再略做说明。

如上图所示,亚马逊上游主要有两条河流,北面的一条叫做Maranon河,从源头到和另一条河流Ucayali河的汇合点是1600公里。南面的一条河叫Ucayali河。总长度为2669公里。所以所谓的传统源头不是Maranon河。Ucayali河又分为几段,从下游往上游数,依此是Ucayali河,Tambo河,Ene河和Apurimac河。Apurimac河是现在公认的亚马逊河的最上游的一段。从地图上看到,Apurimac河直接发源于Mismi山,由南往北流。而Apurimac河流过730公里后(旧数据),和一条由北向南流的和Martaro河汇合。这条Martaro河源于秘鲁中部,从其源头到和Apurimac河的汇合点为724公里。所以有理由相信那个所谓的传统认定的起源点就是Martaro河的源头。

Apurimac河的源头Mismi山是安第斯山脉中的一座火山,位于秘鲁首都利马东南700公里处。最高点有5597米高。在山的北坡,有一条冰川融化而成的小溪叫Carhuasanta小溪,这条小溪就是亚马逊河的源头。在下图中十字处就是小溪的源头之一。

根据BBC的报道,真正的源头还没有最后确定,但是无论最后确定是哪一个,亚马逊河的长度都比尼罗河要长。我在网上还没有看到正式的论文,所以也不知道他们的研究细节。等论文公开了后,我再详细介绍一下。

从个人感情上,我倒是希望这是真的。象尼罗河这样的小流量的,有时甚至会枯竭的河被排在世界第一,怎么也不是滋味。

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【进化生物学】埋藏在你身体里几百万年的病毒

【进化生物学】埋藏在你身体里几百万年的病毒

文:尼伯龙根·蜗藤

在一般人眼中,病毒是令人生厌、唯恐避之不及的东西。但你又是否知道,每个人从生命诞生的一刻开始体内就有数以千计的病毒?这些病毒深藏在你的身体里,嵌刻在DNA中,甚至还会搭上“便车”,一代一代地传给你的后裔。这并非耸人听闻的杜撰,而是铁一般的事实。但你也不必要惊慌,因为这些病毒中的大部分已经没有感染力了。

这类可以代代相传的病毒叫做内源性反转录病毒(endogenous retrovirus)。要了解这种病毒,就不得不从反转录病毒说起。反转录病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。一般的RNA病毒,比如流感病毒,在寄主体内只会通过RNA到RNA的方式进行复制,复制过程不牵涉DNA分子。但反转录病毒不同,它有自带的武器——反转录酶。这种酶能够实现从RNA到 DNA的转录。当初,这种转录过程的发现可是科学界的一件大事。因为根据遗传学的中心法则,遗传信息是由DNA到RNA再到蛋白质传递的。所以这个从 RNA到DNA的过程是违背这个金科玉律的(这就是为什么叫反转录的原因)。这个发现是在遗传学认识上的一个飞跃,而发现反转录酶的科学家就在此发现后短短的5年内获得了1975年的诺贝尔奖。

在这种反转录酶和其它一些机制的作用下,反转录病毒的RNA能转录出异常活跃的DNA片段。这种DNA片段能插入寄主的DNA中,跟随寄主的DNA复制而复制。一旦插入后,就没有办法把它从寄主的DNA内除掉了。这种插入对寄主DNA的功能有时会有很大的影响,引起各种病变。大名鼎鼎的艾滋病毒HIV就是其中的一个代表。当然很多时侯,这种插入对寄主并没有即时的影响。

正常情况下,反转录病毒只入侵人或者动物的体细胞,被称之为外源性反转录病毒。尽管它能永远的插入到它入侵的体细胞内,但并不通过DNA殃及下一代(艾滋病毒是通过母婴血液传染给后代)。但是某些反转录病毒在机缘巧合之下,能入侵到人或动物的生殖细胞内,被称之为内源性反转录病毒。这种病毒侵入了生殖细胞后,它的DNA就永远整合到精子或者卵子的DNA中,并且和生殖细胞的DNA一起从父母传到子女,千秋万代,代代相传,成为寄主基因组的一个部分。

我们身上的DNA也整合了历经数百万年遗传下来的病毒基因。这些基因,记录了我们远古的祖先(当时还不是人类呢)被反转录病毒肭值睦贰3こさ乃暝鲁恋碇螅庑┎《净蚴吭嚼丛脚哟蟆>萃臣疲谌说幕蜃槔锩嬗?8,000个病毒的基因碎片,总量占整个人类基因组的5~8%。据估计,这些碎片分属于20几个科的几千种不同病毒。

对于这些来自外界的基因,人体也自有一套对付的办法。宏观上最有效的当然就是自然选择——危害太大的病毒会导致寄主的死亡,寄主越早死亡,他产下后代的可能性就越小,这种病毒基因就越有可能被淘汰。从微观上说来,寄主也有一套减轻危害的方法。比如通过加入终止子(stop codon)还有移码(frameshift)等方法,使得这些基因无法表达成蛋白质和无法到处乱插(专业上叫转移,transpose)。只要病毒基因不表达不乱插,那么它的危害性就大大减弱。总之,经历了上百万年的战斗后,绝大部分病毒基因都变成一块块的片段式的沉默的基因,无法再对人体产生任何有害的作用。因此尽管人类基因中含有如此多的内源性病毒基因,却无需为此担心。

病毒世界竞争激烈,各种病毒来势汹汹,但是消逝得也快(当然是相对生物进化的时间尺度而言)。当年肆虐一时、不可一世的众多反转录病毒基本都已经绝迹。而那些小部分的入侵人体、变成内源性的病毒,在其基因整合入人的DNA后,随着时间的流驶变成了一具具“化石”,成为我们构建病毒入侵历史的宝贵证据。

然而,经过百万年的淘汰、变异和演变,大部分病毒基因都变得支离破碎,面目全非,因此从这些基因片段中寻找病毒发展的踪迹非常困难。可是随着大规模的基因组测序的完成和计算机运算能力的加强,科学家们开始有办法重组这些碎片。如果病毒整合到基因组的时间越晚,那么它的变化就越小,也就越容易被科学家窥破其本来面目。

目前,仅有一种病毒,也就是最“年轻”的HERV-K(HML2)病毒基因能被重组并深入研究,我们姑且称之为HERV-K病毒。这种病毒大约从3000 万年前开始流行,那时地球处于渐新世(oligocene),猿类正在和猴子分家。但是之后很长一段时间里,HERV-K都只入侵到体细胞,属于外源性病毒。直到在600万年前它才阴差阳错地入侵猿人的生殖细胞,正式整合到猿人的DNA。可以肯定的是,当时只有一部分人的生殖细胞被这种病毒感染,而我们现在所有的人类,都是这群猿人的后代。当时猿人已经和黑猩猩等类人猿分家,所以类人猿DNA里没有这种病毒的基因。

HERV-K是极少有的只有人类才独有的内源性反转录病毒,因此一直被病毒学家重视。2006年,生物学界平地掀起一场波澜,起因是法国科学家 Thierry Heidmann宣布要令HERV-K复活。他扬言已经找到了HERV-K隐藏在人类基因组中的所有基因,而且要用这些基因的信息,辅以现代生物学技术,重新制造出一个完整的HERV-K病毒。从科学的角度来看,这的确激动人心,好比从几本残破的竹简中翻译出来一部古文尚书。可是如果真的付诸行动,成功地使这个绝种几百万年的病毒“复活”,其潜在的危险有可能远远超出当代人类可以承受的范围。比方说,万一Heidmann博士一不小心让这个复活的病毒流入人间,现代人类是否有对抗其入侵的法宝,谁也不知道。Heidmann当然信誓旦旦保证不会出事,并出示了法国政府的批文,但是美国人认为 Heidmann的实验室安全标准达不到美国的4级安全标准,不够安全(按美国的标准,Heidmann的实验室属于3级安全标准)。这场嘴仗最终结果尚不知晓,无论怎样,Heidmann至今尚未使HERV-K复活。

所谓以史为鉴,对内源性反转录病毒的研究除了能使我们对病毒入侵的历史有深刻认识之外,对现在人类对抗反转录病毒也有很大的意义。近期在《科学》杂志上发表的一篇论文介绍了一个有趣的研究。在猿人和类人猿分道扬镳之后,距今3-4百万年前,类人猿就被一种病毒PtENV1入侵到生殖细胞中了。那时大猩猩和黑猩猩还没有分家,所以它们的基因组里都有这个病毒。另外,亲缘关系更远的猕猴身上也有这个病毒的残骸,但是猕猴基因组里的这个病毒的基因和猩猩们的差距较大,所以很可能是两个独立的入侵过程。可以想见的是,这种病毒当时横行于灵长类动物中。但是人类的基因组里面并没有这个病毒,这很可能说明人体中有一种反抗的机制有效地抵抗了该病毒的入侵。科学家Michael Emerman的小组认为他们找到了这种机制。

该研究小组注意到在所有灵长类,包括人的细胞里有一种叫做TRIM5α的蛋白质。尽管各种灵长类体内的TRIM5a都各有差别,它们都能够认出病毒并抑制病毒。但是这个蛋白质有一个有趣的特点,就是非常容易特化。也就是说,当某种病毒入侵时如果TRIM5α发生作用,对其进行了有效的抑制,并记住这种病毒的特征,那么它从此也就丧失了对其它病毒的抑制力。这好比一件法宝,未使用之前有无限的可能性对付各种敌人,可是一旦出动这个法宝,其威力只能有效对抗它的第一批敌人,而对其后的不同敌人就无可奈何了。

研究早已发现人体内的TRIM5α对HIV病毒是没有抑制力的,但是猕猴、大猩猩和黑猩猩体内的TRIM5α却都对HIV有抑制力。于是,结合猕猴和猩猩曾经被PtERV1病毒入侵的事实,Emerman提出了一个大胆的设想。他认为:当年PtERV1病毒也曾入侵过人体,但是当时猿人的身体里的 TRIM5α发挥了作用,成功的阻止了PtERV1病毒的入侵。可是由于这个法宝已经先用来对付PtERV1了,所以它对以后入侵人体的HIV病毒就没有法力反抗了。相反,猕猴和猩猩当时都没有动用TRIM5α这个法宝,以致被PtERV1病毒侵入,甚至连生殖细胞也失守。但是这个“忍耐”是有回报的:到了后来HIV施虐的时候,TRIM5α的法力就发挥了作用。

Emerman的实验结果证实了人类的TRIM5α的确对PtERV1有抵抗力,从而初步证实了他的猜想。也就是说,人类的TRIM5α确实有可能曾经对付过PtERV1。无论最终的结论如何,这都是一个非常有意思的研究。重构生物历史的乐趣并不比重构人类文明的历史少。而重构这段历史,无疑让我们对病毒和反病毒斗争的认识更深一层。如果Emerman的猜想最终被证实成立,TRIM5α就真的好比孙悟空的救命毫毛,不到最后关头不得使用。猿人当年面对 PtERV1病毒入侵没能“忍住”不让TRIM5α出手,结果令他们千秋万代之后的后代遭受HIV的肆虐。当然,猿人根本不可能知道TRIM5α的存在效用和控制它何时出手抵抗病毒入侵,更无法预知几百万年后HIV会带给其后代如此巨大的灾难。

物种如何生存繁衍下去,对远古的猿人而言基本上只能是出于生理的自发反应和纯粹的自然选择。然而随着科学研究的深入和技术的飞跃,现代人类面对这个问题,可以自主能动控制和取舍的空间越来越大。而在这种能动的选择过程中,对生存和发展的价值判断和调整给人类带来的挑战不小于如何更深入地科学研究生命及其发展的历史。当代人与人的关系、人与生态环境的关系、人与其它物种的关系、现代与后代的关系等等都是现今人类社会不能回避和必须谨慎权衡的重要问题。

参考文献:

1.  S.M. Kaiser et al, 2007. Science, Vol. 316, 1756-1759

2.  R. Belshaw et al, 2005. Journal of Virology, Vol 79 no.19, 12507-12514

3.  R. Belshaw et al, 2004. PNAS, Vol. 101 no.14, 4894-4899

4.  S.P. Goff, Retroviridae: the retroviruses and their replication. In David M. Knipe and Peter M. Howley (Ed), Fundamental virology (4th Ed.), Lippincott Williams & Wilkins, 2001, 793-842

5.  Martin Enserink, Viral fossil brought back to life. ScienceNow Daily News, Nov 01, 2006

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翼龙列传(一)

翼龙列传(一)

文:尼伯龙根·蜗藤

未经作者授权,请勿转载或引用

自起源以来,脊椎动物在征服海洋和征服陆地的过程中可谓顺风顺水,大获全胜。然而,在脊椎动物史上的前2亿年,却有一处令它们望洋兴叹的空间——天空。可以说,相对于海洋和陆地,天空是脊椎动物最大的挑战。这是因为空气所能提供的弱小浮力与地球对动物的强大重力对比反差巨大,而对于大动物来说,这更是一个难以逾越的障碍。在脊椎动物进化的过程中,无疑涌现了很多善于缓降(parachuting)和滑翔(gliding)的动物,但真正能做到主动飞行(powered flight)而彻底征服天空的脊椎动物只出现了三类:翼龙(pterosaur)、鸟和蝙蝠。翼龙最早出现在两亿两千五百万年前,是第一个冲上云霄的脊椎动物。在其出现七千五百万年后,鸟类才出现。当翼龙在六千五百万年前,和其兄弟恐龙、蛇颈龙等一起灭绝时,蝙蝠还要等待一千五百万年才初现于世。

除了是第一种会飞的动物之外,翼龙还有另一项第一的记录:它是有史以来在天空出现的最大的动物。最大的翼龙体重估计有250公斤(一说130公斤,根据不同的模型),这至少相当于一个成年的两米多高的强壮男子的重量(对比一下,姚明的重量是140公斤左右)。翼龙的骨架轻,所以它的实际体积更加令人震撼 ——它双翼展开达12米之长,相当于一部小型滑翔机的翼长。但如果我们仅仅从“大”的方面去认识翼龙,就会忽略了翼龙的多样性和在广泛占领各种生态位时所取得的成功。事实上,在侏罗纪的翼龙大部分只是乌鸦大小,最小的翼龙体长甚至只有麻雀大小,而各种庞大的翼龙都是在白垩纪才出现的。

翼龙是初龙(Archosaurs)的一枝。初龙在三叠纪早期就分化出来为两大类,一类是镶嵌踝类(Crorutarsi),它最终发展为鳄鱼;另一类是鸟颈类(Orinithodira),最终发展为翼龙及其最亲的兄弟恐龙以及鸟类。尽管翼龙确实是由初龙进化而来,但是哪一类初龙才是翼龙的直接祖先却很难准确的考证。这是因为目前发现的最久远的翼龙化石都是属于已经拥有相当成熟飞翔能力的翼龙,而更原始的翼龙化石尚未被发现。翼龙化石稀少一直是翼龙研究的难点。到目前为止,已发现的翼龙标本数目不过100件左右,实在不足以构建出整个翼龙起源和发展的历史。

翼龙的飞与行

人们总是对古生物的生态特别感兴趣,具体说来,就是它们是如何运动的、生长在什么地方、吃什么东西等等。作为第一种会飞的动物,翼龙备受科学界关注的当然是它的飞行。在以往的古生物学界中有一种对爬行动物根深蒂固的成见,认为爬行动物是低等原始的,恐龙如此,翼龙也是如此。由于种种的成见和误解,翼龙在传统上长期被错误地想像成一种很原始落后的飞行动物。然而,对于翼龙这种最早冲上云霄、统治天空长达1.5亿年之久的脊椎动物,我们又岂能仅仅用“原始”二字来描述它呢?鉴于历史上这种成见对爬行动物研究的负面影响很大,我接下来将对翼龙研究中的观念变迁做一个回顾,相信这将有助于破除上述成见。

翼龙的飞行能力和在陆地的行走能力是翼龙研究中争议最大的领域。虽然同为飞行的脊椎动物,翼龙翅膀的结构与鸟类和蝙蝠的有本质的不同(图1)。鸟类的翅膀以整个上肢作为依托,骨架坚实,肌肉发达,利用羽毛获得飞行所需的上升力。蝙蝠的翅膀不如鸟类的坚实,以整个手掌作为依托,以四个手指之间的皮肤构成翅膀,这个以皮膜为主的翅膀还延伸到肋部和后肢。翼龙的翅膀虽然也是由皮肤衍生而成,但是与蝙蝠不同,翼龙的膜大部分是以长得夸张的第四根手指骨为支撑。所以看上去,翼龙的翅膀极为脆弱。(关于飞行力和翅膀的详细讨论,语见中生代·飞行志)

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图一:三类翅膀比较(来自http://www.ucmp.berkeley.edu/vertebrates/flight/

从上到下:翼龙,鸟,蝙蝠

传统的观点无法想像一根手指骨能够承受如此剧烈的运动,因此认为由于翼龙的翅膀非常脆弱,它不能够进行主动飞行。由于爬行动物在传统上被等同于冷血动物,因此也很难想像作为爬行动物一员的翼龙可以有足够大的代谢率来维持主动拍翅飞行。而传统观念也认定越重的动物越难飞行,所以也很难想像翼龙这种重达240 公斤的庞然大物能够飞到天空中。因为这些原因,翼龙就被认作是一种只能翱翔的动物。

我们知道,在脊椎动物史上只有三类动物能够真正地飞行——其中鸟类利用羽毛飞行,而翼龙和蝙蝠都是利用皮肤衍生出来的皮膜飞行。翼龙的研究历史尤为强调翼龙和蝙蝠在飞行工具上相似性。蝙蝠的翅膀以手掌为主,一直连到肋部、脚踝和尾巴,而在复原翼龙的形状时,研究者也认为翼龙的翅膀一直延伸到脚踝。而在大部分化石中,翼龙的皮膜痕迹也都是和下肢有联系的。由是,翼龙的翅膀一直延伸到脚部的论断在很长的时间都未受到质疑。

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图二:传统的翼龙复原图。Soemmerring于1817年绘制 (Padian 1983)

于是从传统的角度看来,翼龙是一种庞大而古怪的动物。由于翅膀把手部和脚部连在一起,翼龙在陆地的行走极为笨拙,只能象蝙蝠一样在陆地上“可笑”地爬行。又因为翼龙只能滑翔,所以不能在平地上起飞,而只能从高高的悬崖向下滑行,借助风力降落到另外的悬崖上。这样一来,降落在平地上对于翼龙而言是一场彻头彻尾的灾难——倘若真的如此不幸,它就只能一步一步的爬回到高处。这对于翼龙如此庞大的动物而言,简直是不可完成的任务。万一翼龙真的不能借助风力回到悬崖上怎么办?科学家设计了一个看上去还可行的方案 ——翼龙不是在前肢上还有3个爪子吗?那么它可以利用爪子附着在峭壁上,然后利用前肢的力量,一步一步的向上爬回悬崖上。若果真如此,我们可以想象在中生代的海边的峭壁上,一定有很多的翼龙“挂”在峭壁上了。

这种刻板的印象一直持续了一个多世纪,直到20世纪80年代,古生物学家K. Padian才对这种观念提出挑战,而随之而来的一系列发现和大争论更逐步扭转了古生物界对翼龙的认识 (Padian 1983)。Padian首先注意到了一件一直被古生物学家忽略的翼龙化石,通称Zittel wing(图)。这件化石属于Rhamphorhynchus(属于第一类也就是早期的翼龙Rhamphorhynchoids),由德国古生物学家K.A.von Zittel在1882年发现,是一具保存得特别好的翼龙化石。和其他化石不同的是它清楚的显示了翼龙拥有流线型的翅膀。可是如果按照传统的看法,即翼龙的翅膀一直连到脚踝部,翼龙就应该有一双宽大而并非流线型的的翅膀(图)。

耐人寻味的是,其实这具化石早已经被发现很久了,但可能是因为它显示的信息太迥异于传统的观念,一直未被古生物学界重视。根据Padian自己的考证,古生物学界这种传统的观念源于1817年发现第一具翼龙的标本。有趣的是,当时的科学家von Soemmerring以为它是一种大蝙蝠的化石,根本没有意识到那是一种之前未被发现的新的爬行动物。因而他就完全按照蝙蝠的形态把化石进行还原。后来,即便当科学家意识到那其实是一种爬行动物的化石后,也仍因循着Soemmerring的思路。因此,在1882年Zettel描述自己发现的样本时,被传统思想影响的科学界就有意无意地“忽略”了他的发现。

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图三:Zittle Wing,1882年K.A.von Zitte发现的翼龙化石

(自http://www.pterosaur.eu/identify/wings/wing2.htm

从这点出发,Padian继续研究了其他的翼龙化石。在英国有一具Dimorphodon(双型齿翼龙,也属于早期翼龙 Rhamphorhynchoids)的标本。Dimorphodon的双翼展开只有4英尺(约1.3米),大小和鸟类和蝙蝠相当,如果按传统的宽大翅膀计算,它的翅膀面积比维持它飞行所需要的面积大65%。但如果认为它拥有流线型的翅膀,即翅膀只延伸大下肢的上部,而非脚踝处,这个翅膀的大小就正好能和其体积般配。(这点我保留意见,逻辑上有先结论而后论证的弊病)

接着Padian又仔细考察了支持传统说法的化石标本,特别是位于耶鲁大学博物馆内的那具(当时Padian是耶鲁大学研究生),他突然发现原来标本上一直被认为是翅膀连到脚踝处的痕迹其实只不过是翅膀被压在了脚踝下面。换言之,所谓翅膀和脚踝相连,只不过是一种化石形成过程中的巧合。而当他继续考察其他标本的时候,他发觉根本没有一具保存完好而姿势舒展的标本能够证明翅膀和脚踝部相连。

此外,根据翼龙的脚趾的形态,他认为翼龙的脚趾与鸟相近而完全不同于蝙蝠。并认为,翼龙是一种双脚行走的动物,而不是四脚爬行的动物。翼龙有着类似于鸟类的宽大的胸骨(sternum),而胸骨上也有类似鸟类的龙骨突起(keel),尽管这个突起并没有善飞的鸟类那么高,但是和一些中等飞行能力的鸟有可比性。所以翼龙应该是可以主动拍翅飞翔的。

在Padian笔下的翼龙Dimorphodon,是一个惊天骇俗的形象(图)。他认为,翼龙是一种能够双脚行走乃至快速奔跑的动物,在行走时,它的双翅折叠起来,象一把剑一样树在背后,犹如一个持剑而行的侠士。而且,它能在奔跑中获得足够的速度令自己在平地上起飞。所以在Padian眼中,翼龙是一种能跑能飞的动物,而不是只会滑翔和在地上匍匐的可怜虫。Padian笔下的翼龙形象彻底的颠覆了翼龙在学术界的形象,可谓影响深远。

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图四:Padian的Dimorphodon复原图 (Padian 1983)

其实Padian不是一个人在战斗。在这之前的几年,德国古生物学家Wellnhofer通过研究7个翼龙标本,也得出了翼龙的流线型翅膀的结论。不过,Wellnhofer的结论和预测都比较谨慎,所以并没有得到很大的反响。可见一个大胆假设在科学研究中是多么的重要!在Padian和 Wellnhofer的推动下,对翼龙的重新认识成为了古生物学界的一个热门。很多有利于翼龙主动飞行能力的证据相继被发现。

证据一:翼龙可能有毛,有可能是恒温动物。大家知道,哺乳动物有毛,鸟类有羽毛,毛和羽毛都是可以用来保持体温的。长久以来,爬行动物一直被认为是变温动物或者冷血动物,也就是说,它们缺乏调节和保持体温的机制,因而体温会随着环境温度变化而变化。当体温变低后,生理活动也减慢。所以一般说来,变温动物新陈代谢律都比较低,而这么低的新陈代谢率实在不足以支持动物主动飞行(关于体温的问题,详见中生代·体温志)。但是随着对爬行动物和鸟类关系的认识的进步,把爬行动物和冷血动物直接划等号的看法逐渐被科学界抛弃。特别是带羽毛的恐龙被发现后,这种陈旧的看法终于画上了终止符。

既然恐龙可能是恒温动物,那么作为恐龙的表亲的翼龙,为什么就不可能是恒温动物呢?事实上,众多的翼龙的标本上都有毛发的痕迹,而最早发现的相关标本甚至可以追溯到一个世纪之前。最清晰地反映出翼龙有毛的化石是发现于哈萨克斯坦的翼龙(Sordes pilosus), 这也是早期翼龙Rhamphorhynchoids的一种。如果翼龙真是有毛的,那它就很可能是恒温动物,若果真如此,它能够进行主动飞行的可能性就非常大了。

证据二:翼龙的骨头内有气囊(air sac)。翼龙的骨骼如同鸟类一样,都是中空的,这点是为了减轻骨头的重量,是对飞行的一种适应。这并不足为奇,无论主动飞行的动物还是滑翔的动物都可能有这种结构。鸟类在其骨骼中有一种特殊的气囊结构,气囊是通过骨骼上的小孔(foramina)直接和呼吸系统相连的。它起着双重作用:一来可以增强呼吸能力;二来可以进行体温的调节。后者对于主动飞行的意义更大,因为在主动飞行的过程中,由于耗费巨大的能量,产生的热量也是惊人的,而如果热量不迅速排出,体温就会急剧升高。这些中空的骨骼,还有和呼吸系统相连的骨骼内的气囊,是很好的排热通道。在翼龙的骨骼上,有着和鸟类完全一致的小孔(foramina),这大大支持了翼龙骨骼内有类似的气囊的结构和拥有主动飞行的能力的论点。

证据三:人们一直认为,体重越大的动物就越难飞行,对于起飞来说更是如此。但是Marden在1994年发表的论文对这个问题进行了详细深入的分析,反驳了这一观点。他对众多主动飞行动物的实验研究科学地证明了这种传统观点不过是想当然而已。根据这篇论文的数据显示,单位质量的爆发提升力(mass- specific short-burst lift)和体重大小并没有相关性,而单位质量所提供的能量,和体重大小更成轻微的正比关系。而和体重大小成反比的是单位质量维持能量输出的能力。这意味着,象翼龙如此巨大的动物,它的起飞不是一个问题,缺乏的只是长久飞行的能力,而后者是可以靠翱翔来解决的,正如信天翁一样。

证据四:在翼龙翅膀发现的纤维和肌肉的结构。以前一个很不利于翼龙主动飞行的证据在于翼龙翅膀的薄弱。但是哈萨克斯坦的翼龙标本上,能够清楚的发现翅膀上有密集的纤维,而纤维中间,可能有众多小块的肌肉相连接。这种结构的存在改变了一直以来认定的翼龙的翅膀仅仅只是一块大皮膜的看法。这些纤维的存在使得翼龙的翅膀的强度大大增强。而其中的肌肉,又可以灵活的调节翅膀的方向和角度,令翼龙更加便于控制其飞行。

在这些相关发现的冲击下,至今为止关于翼龙的飞行能力已经有了基本统一的意见了:翼龙是可以主动飞行的,尤其在起飞和着陆的时候,尽管在空中时它还会象信天翁一样地翱翔。对翼龙翅膀下沿的位置,目前还有一定的争议。但是即便是认为翼龙的翅膀和下肢相连的观点也认为其下沿不过到下肢上部,即膝盖以上的位置,而那种翅膀延伸到脚踝和尾巴的观点已经被彻底抛弃。这个区别对于翼龙在陆地的行走能力的影响巨大。如果翼龙的翅膀只连到膝盖上部,那么翼龙的下肢就有很大的活动空间。

关于翼龙在陆地的行走能力,目前争议还很大。有化石表明,翼龙的髋部太宽,以致后肢向外伸展,并不能采取双腿站立的姿势;在1997年发现的翼手龙 Pterodactylus(属于后期翼龙Pterodactyloids的一种)的足印更是清楚的显示了这种翼龙是可以四足行走的动物(Unwin 1999)。

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我认为,翼龙到底是四足行走还是两足行走,很可能因龙而异。在翼龙的表亲恐龙中,有四足行走的种类,也有两足行走的种类,很可能翼龙也是如此。而一些翼龙即便不能稳定的双足站立,它在起飞时候仍可以短暂地采取两足行走的前冲姿势(尽管不能很好的前后平衡),同时双翅拍击而取得起飞所需的起始速度从而成功起飞。一些大型鸟类比如天鹅等,其行走也是笨拙的,但不妨碍在飞行前让它们短暂冲刺以获得加速度。另外,历史上有多次把鳄鱼的足迹误读为翼龙足迹的例子,所以对于翼龙足迹的准确性还需要历史的考验,不能估计过高。总之,目前相关的资料还不足以为翼龙是四足行走还是两足行走下定论。最后,我觉得如果翼龙完全不能两足行走,那么对于起飞是一个很大的障碍。翼龙当然可以象传统所说那样从悬崖峭壁上起飞,也可以尽量试图不降落在平地上。但是对于象翼龙这样主要以捕鱼为食的动物,很难想象它不会有降落在平地或者河边的时候。如果它完全不能两足行走,这样的降落对于它们来说就是一种灾难。这个在进化上是一个很大的缺漏。另外,最大的翼龙Quarzalcoatlus生活在内陆,其生活环境既没有悬崖也没有峭壁,它的庞大体积(约240公斤)也不允许它爬树,如果不能从平地起飞,那它的生态就难以想象。

下一部分就要写到翼龙的进化,将着重介绍几种代表性的翼龙。

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主要参考(除了通用的几本古生物学书之外的,见序言):

Peter Wllnhofer. (1991). The Illustrated Encyclopedia of Pterosaurs

Shipman, Pat (1998): Taking wing : Archaeopteryx and the evolution of bird flight

Marden, J. H. (1994). "From damselflies to pterosaurs: how burst and sustainable flight performance scale with size." Am J Physiol 266(4 Pt 2): R1077-84.

Padian, K. (1983). "A Functional Analysis of Flying and Walking in Pterosaurs." Paleobiology 9(3): 218-239.

Unwin, D. M. (1999). "Pterosaurs: back to the traditional model?" Trends Ecol Evol 14(7): 263-268.

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MD,一个远去的背影

MD,一个远去的背影

文:尼伯龙根·蜗藤

7月27日,在minidisc.org论坛上看到消息,说sony在新推出的数字音乐播放器中将不再支持atrac格式的音乐,这无异于宣告sony不再继续推广atrac格式的音乐,这无疑给已经日渐消沉的MD加上最后一脚。本文,就是对MD的一个怀缅。

MD是sony生产的MiniDisc的简称,首次亮相在在前电脑化年代的1992年(原型在1991年亮相)。当时MD的目标是取代录音带,成为一种便携的可录式设备。Sony的构想的是一个类比关系:大碟唱片(LP)和卡式录音带(cassette)都是模拟设备,CD和MD都是数字设备。LP既然由CD取代,卡式录音带在数字年代就应该有一个对应的东西,于是MD就应运而生了。

对比卡式录音带,MD的优点很多。首先MD是数字格式的录音,音质不会随着时间而劣化。其次MD可以直接从CD数字式录音,理论上说来,音质不会因为转录时的噪音而降低。再次,MD是转盘式设计,放音时选取声轨远比tape式的录音带方便。最后,MD的转盘式设计使转速的稳定性比卡式录音带高,录音带旧了后转带速度忽快忽慢的情况不会产生。另外,MD碟片有硬壳保护,所以非常耐用。由于这些优点,sony推出MD播放器时可是信心满满的。

可惜,sony的如意算盘没有实现。原因主要有以下几个,首先作为便携式设备,MD面对的竞争除了cassette之外,还有CD。CD的体积在现在的眼光看来,算是庞然大物,但是在90年代的时候,却是非常便携的,至少,对比起LP来说是这样。MD的体积尽管比CD小(CD用的是5.25寸的盘,MD用的是2.5寸盘)更便携,但是差别不是十分大。其次,MD的音质和CD有一定差距,尤其是早期的MD。再次,和盒带相比,pre-released的MD始终不成气候,这样大大限制了MD作为播放器的效用。毕竟不是很多人喜欢自己录音编辑再去听的,尤其是CD非常方便的情况下。最后,MD的成本比卡带贵,prerecorded的MD价钱比得上CD,但是prerecorded的卡带价钱仅是CD的1/5到1/10。空白MD的价格也比卡带贵许多。这些都是MD不得以大规模流行的原因。尽管如此,作为电脑大规模普及前的数字设备,MD还是取得很大的成功。在日本和香港,MD的销量都相当不错。但是在欧美和尤其是中国大陆,MD都没有取得相近的普及率。

第一台MD, MZ1 

从1992年到1998年,MD的格式一直在进步。MD采用的是一种叫做ATRAC的文件格式,这是一种有损压缩格式。在不断改进中,MD的声音效果越来越好,从刚开始时的比FM稍高的品质,一直提升到类似和接近CD的品质。这本来是有助于MD不断扩大市场的。可是这时电脑的快速普及和MP3的开始流行,成为MD的一个噩梦。

很多人把MP3看作是数字音乐的开端。但严格的说来,CD和MD都是数字音乐。MP3之所以特别,是因为它和电脑的紧密结合。音乐CD一开始不是为电脑所制定的,所以如果把CD的内容保存在电脑上需要特殊的抓轨软件,而不是直接复制和粘贴。一旦抓轨之后,CD上的音乐就可以保存为WAV格式,就可以任意拷贝了,这个对于音乐的保存、编辑和传播都非常便利。WAV是一种未经压缩的文件,体积相当的大(以90年代中后期的标准),相当占用硬盘空间,也不利传播.设想一下当时很多人还是用14.4k的modam,所以一个对WAV文件的压缩过程是必须的。MP3就是最流行的一种压缩方式。最初流行的mp3的编码率是128k,音质远不能和ATRAC相比。但是mp3可以通过保存在硬盘上听,可以挑选自己喜欢的歌放在mp3播放器上听,从网络上下载又非常容易,所以mp3迅速成为流行的音乐格式。

对于电脑时代的冲击,sony并不是没有反应,可是就是从这时开始,sony就进入一个昏招迭出的年代。Sony针对电脑的应用,2000和2001年推出两招措施。2000年,sony引入新的文件格式,MDLP。MDLP是一种以降低音乐质量为代价减少文件体积的格式。MD的编码率是292kbit/s,而LP2的编码率只有132kbit/s,而质量更低,体积更小的LP4,编码率更只有66kbit/s。从编码率的对比来看,LP2的质量稍好于128k的mp3,而LP4的质量比起最初的MD还不如。(当然由于atrac和mp3的编码方法不一样,不能仅从编码率来比较文件的优劣)。索尼的这招是为了对抗当时的mp3播放器。当时主流的mp3播放器是32M或者64M闪存。以一首歌4M算,64M可以放16首歌,约1小时的音乐。而如果MD用了LP2的格式后,就可以放大概160分钟的音乐,比mp3播放器时间要长。

第一台MDLP recorder  MZ-B100

2001年,sony推出一个更大的措施,这就是NetMD。NetMD对于MD来说是一个革新,它能从电脑上把歌曲传到MD上。这样,对于有电脑的用户来说,无疑是大大方便了,这也是sony的顺应电脑潮流的一个发展。Sony的另外一个考虑是,可以在网上发售数字音乐,然后用户可以把音乐传送到NetMD上听。应该说NetMD是顺应潮流的,对于延续MD的生命起到重要的作用。但是NetMD有几大弊端,奠定了MD败亡的基础。

首先把音乐文件传输到NetMD上必须使用专用软件SonicStage。这是一个界面和操作非常不符合Windows用户习惯的软件,用户评价非常低,可以用臭名昭著形容。

其次,处于版权的考虑,传输文件限制非常多:

1. 电脑抓轨后传到NetMD上只能使用质量较低的LP2或者LP4的格式,而不能使用高质量的SP(传统的MD格式)格式。这样一来,希望享受高品质的音乐的用户根本不能从NetMD中获得任何好处。

2. 音乐文件只能从电脑传到NetMD,而不能从NetMD传到电脑。不仅从电脑抓轨的音乐文件如此,就连按传统方式录的声轨也不能传输到电脑上。这样就大大限制了和电脑结合的意义。

3. 由电脑上传输过去的文件在NetMD上不能删除和修改,想删除,必须连到电脑上由Sonicstage操作。

4. 早期的SonicStage不支持其它格式的音乐文件(包括mp3),只能从CD上转录成为atrac格式

由于种种限制,NetMD和MP3播放器比起来使用十分不方便。

而且,由于电脑操作的缘故,MD盘片非常容易由于误操作而导致TOC区域受损,而MD盘又没有一种能够重新格式化的工具,所以一旦盘片受损,就只能报废。另外,NetMD和当时的MP3播放器比起来,还有机械上的劣势。由于MD是转盘式的设计,不可避免就有机械噪音,不可避免就有震动而出现的跳轨,而当时基于闪存的MP3播放器就先天性的对此免疫。

第一台NetMD MZ-N1

平心而论,在NetMD出现的时候,MD相对于MP3播放器还有很多优势,特别在音质上,MD的接近CD音质的SP模式自不用说,连LP2模式也比当时的128k的mp3强。况且MD还有无间隙播放的功能(gapless playback),这点对于听交响乐,歌剧和live concert的人来说非常重要。MD盘的容量越177MB,这比当时主流的MP3播放器大一倍以上,而且用户可以同时携带几张MD碟以扩充容量,MD碟的价格比闪存便宜得多,这些也是很大的优势。所以其实若非sony的失误,MD还是大有可为的。

Sony的失误在于太过首鼠两端,从MD定位来说,一方面,sony仍然把MD看作是一种它一向擅长的传统录播设备,另一方面,sony也想把MD往电脑时代上靠拢,所以到头来是两头不到岸。从数字音乐方面来说Sony一方面要普及MD的格式,另一方面又要维护版权(sony同时也经营唱片),所以在普及和限制中自相矛盾。这两方面的矛盾使得sony弄出了SonicStage和各种限制这中怪胎。

电脑科技的发展十分迅猛,2000年开始CD刻录机开始大规模普及,用户可以复制整张CD,甚至可以自己挑选歌曲刻录在CD上听。这样一来,原先只能在卡式录音机和MD上进行的音乐复制和编辑工作就可以完全通过电脑进行。CD的质量当然比MD要更好,CDR盘片的价格和MD甚至空白盒带对比也非常便宜。这样一来,使用MD的复制的重要性就大大减低了。与此同时,一批CD/MP3播放器应运而生。这种设备,能够播放存放在CD上的mp3格式的音乐。由于一张CD有700MB的存量,可存放10张专辑的mp3,大大超过了MD的存量,MD大容量和扩充性强的优点便荡然无存。同时,电脑硬盘容量上升,网速的加快,使得高编码率的mp3开始普及,192k的mp3渐成主流。这种编码率的mp3音质比LP2要强,这使得NetMD音质上的优势也开始丧失(当然用传统方式录制的SP模式仍然比这种码率的mp3强,但无法通过电脑录制)。

2001年对于数字音乐播放器是重要的一年,10份,苹果公司推出了第一台基于硬盘的iPod。随后几年间iPod的市场不断扩大,而其它大容量的数字音乐播放器也相继推出。与之相比MD的进步显然太慢。导致市场不断丧失。2004年,sony公司推出企图力挽狂澜的产品Hi-MD。Hi-MD的卖点是:

1. 推出容量为1GB的盘片,而且Hi-MD播放器也能重新格式化旧的MD盘,并把其容器扩大到340MB。

2. 推出了全新的音乐格式atrac3plus,编码质量大大高于atrac3(即LP2和LP4),其中的Hi-SP模式能达到256k的解码率,音质接近CD。

3. Hi-MD可以录制和回放PCM(CD所用格式)格式的音乐,这使得Hi-MD的音质提高到一个新层次。

4. 通过麦克风和模拟录音的声轨可以通过SonicStage上传到电脑。使得MD和电脑的结合更加紧密。

5. SonicStage支持mp3格式,能把mp3格式转换成atrac3plus格式再存放到MD上。

无疑,比起NetMD,Hi-MD是很大的进步,确实是sony准备绝地反击的力作。然而这时,mp3格式基本统治了数字音乐的市场,sony又处于一个左右为难的阶段,如果Hi-MD不支持mp3,那么绝对难以和mp3播放器抗衡,但是支持mp3,又意味着对力推的atrac格式失去信心。所以sony就搞了个如第5点指出的折中方案。然而这个折中方案又是一个两面不讨好的方案,MD的fans觉得是对atrac信心不足的标志,而中立人士就觉得这个转换过程太麻烦:从网络下载的歌本来就只是暂时存放在播放器上听一下而已,要加一道转换的工序就太繁琐了。所以尽管在MD粉丝界Hi-MD是一个突破性的进步,但在市场的反应却不佳。

终于在2005年,第2代的Hi-MD开始支持mp3的直接回放,这个时机的耽误被证明是决定性的,Hi-MD所引起的热潮已经减退,而之前购买了Hi-MD的非死硬派粉丝纷纷喊后悔。而第二代的Hi-MD对mp3的支持,也掩盖不了sony的小肚鸡肠。同一首歌,用mp3格式播放的效果比atrac的效果差很多。后来证明是sony故意弄差mp3的播放效率而凸显atrac优越性的小动作。在第三代Hi-MD中,sony终于去掉了这一个限制。

第一台Hi-MD  MZ-NH1

然而在2005年到2006年之际,用户的听觉要求进一步升高,从mp3等有损压缩到无损格式的要求逐渐成为高端用户的需求。众多的数字音乐播放器都在支持mp3格式之余都能支持wav(PCM)格式的回放。另外Apple发展了无损压缩的Alac格式,Rio、iRiver,iAudio等也支持另一种无损压缩格式flac。Hi-MD支持的Atrac格式在音质上已经处于劣势。MD虽然也支持PCM格式,无奈一张Hi-MD碟,只能存放90分钟的PCM格式音乐,实在太短。这些播放器直接抢走了Hi-MD一直依赖的较高端的听众的市场。这时Hi-MD剩下的优势除了录音,就只剩下无间隙播放了。可是在2005年Rio的Karma已经开始支持无间隙播放,而2006年的iPod也开始支持无间隙播放,而自由软件rockbox的开发,更使众多的播放器能够无间隙播放flac格式的音乐。Hi-MD终于失去了除了录音之外的所有放音的优势。

2006年5月,sony推出了有史以来最好的一个Hi-Md,MZ-RH1。这被广泛的认为是sony对MD粉丝的最后告慰。MZ-RH1集中了所有Hi-MD的优点,比如可以用各种模式(PCM,atrac,atrac3,atrac3plus)录音和放音,完美支持mp3格式,高保真数字式1比特放大器,麦克风敏感度可调节,真正支持USB2.0等等。当然,还有sony在好多年前就应该做的事,完全取消了上传和下载的限制,所有歌曲,无论以何种方式导入MD中的,都能无限制的上传到电脑中。Sony甚至发展了一套无损压缩的atrac格式。Sony在MD将亡之际推出了这么一个接近完美的产品,真是太讽刺了。

最后的贵族MZ-RH1

现在sony已经不在自己新出基于闪存的数字音乐播放器中支持atrac格式了,硬盘式的数字播放器放弃atrac也是不久之事。Sony不再推出新的MD的传言在MD的社群中已经流传很久。种种迹象显示,MD或者彻底消逝,或者只作为录音工具投放在专业或小部分现场录音迷的市场。这样一个精巧的机器,将永远走出我们的时代,成为一个远去的背影。

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